Panamá Departamental
1821 - 1903
Primeramente, el periodo departamental inicia con la Unión a la Gran Colombia dándose después del análisis de la participación de Panamá en el proyecto de Bolívar de crear la Gran Colombia. Los istmeños dejaron claro en el Acta de Independencia de Panamá de España y de unión voluntaria a Colombia. Establecían su autonomía administrativa y su derecho a escoger sus autoridades. Al igual sostuvieron su interés por el libre comercio. Colombia no entendió o simplemente no aceptó las motivaciones de los istmeños, de ahí las constantes reclamaciones e intentos de separación de Panamá de Colombia. Entre los temas importantes de este período están: el centralismo colombiano y el desencanto istmeño. la creación del Departamento del Istmo, el Congreso Anfictiónico de 1826, el fracaso de Bolívar por crear la gran nación Hispanoamérica.
El descontento de los istmeños hacia las autoridades colombianas. Los intentos de separación, el Tratado Mallarino-Bidlack de 1846, el oro de California y la construcción del ferrocarril. En la segunda mitad del siglo XIX, el Istmo de Panamá logra su anhelada autonomía administrativa con la creación del Estado Federal de Panamá. Los intereses norteamericanos en el istmo quedan demostrados con el incidente de la tajada de sandía y las exigencias que pone los Estados Unidos para llegar a un acuerdo con Colombia. El canal francés y la separación de Colombia, incluyendo la Guerra de los Mil Días, el juicio y fusilamiento del general Victoriano Lorenzo.
Colombia rechaza el Tratado Herrán-Hay, lo que lleva a Panamá a buscar su separación de Colombia en 1903, con el apoyo militar norteamericano, quien tenía interés de construir una vía interoceánica por el Istmo de Panamá.